あなたの状況について、まず、労働基準法に基づいて説明します。労働基準法第39条により、労働者は有給休暇を取得する権利があり、使用者はこれを拒むことができません。しかし、あなたの会社では、有給休暇が本人の希望とは関係なくシフトに組み込まれているため、これは労働基準法に違反している可能性があります。

また、有給休暇の申請書を拒否した場合、その日は欠勤扱いにされる可能性があります。しかし、これも労働基準法に違反する可能性があります。労働基準法では、有給休暇の取得を拒否することはできず、また、有給休暇を取得した日を欠勤扱いにすることもできません。

あなたの状況について、上の上司に相談することは非常に重要です。相談する際には、労働基準法の内容を理解した上で、自分の権利を主張することが大切です。また、労働基準監督署に相談することも一つの選択肢です。労働基準監督署は、労働基準法の違反について調査し、是正措置をとる権限を持っています。

最後に、あなたの状況について、法律的・常識的にどうなのかという質問に対しては、労働基準法に違反している可能性があるということが言えます。あなたの権利を守るために、上の上司や労働基準監督署に相談することをお勧めします。