あなたの状況は、勤怠システムの不正操作に関するもので、これは労働法に違反する可能性があります。まず、あなたの権利を守るために、以下のステップを検討することが重要です。

1. 証拠の収集: まず、勤怠システムの不正操作の証拠を収集します。これには、変更された勤怠記録のスクリーンショットや、その変更がいつ行われたかを示すログなどが含まれます。

2. 内部申告: 証拠が揃ったら、会社の人事部門や労働組合（存在する場合）に申告します。これにより、会社が内部で問題を調査し、是正措置を取ることが期待できます。

3. 労働基準監督署への相談: 会社が問題を解決しない場合、労働基準監督署に相談することができます。労働基準監督署は、労働法の遵守を監督し、労働者の権利を守るための調査を行います。

4. 法的措置: 最後の手段として、労働審判や訴訟を起こすことが考えられます。これには弁護士の助けが必要となりますが、法的な権利を主張するための手段です。

このような状況では、まずは冷静に対応し、証拠をしっかりと保全することが重要です。その上で、会社との対話を通じて問題解決を図りますが、それが難しい場合には、外部の機関や専門家の助けを借りることも検討してください。