個人事業主の配偶者がパートタイムで働いている場合、保険証の種類はいくつかの要因によって決定されます。まず、配偶者がパートタイムで働いている会社が社会保険（健康保険と厚生年金保険）に加入しているかどうかを確認する必要があります。会社が社会保険に加入している場合、配偶者はその会社の健康保険に加入することができます。ただし、配偶者の労働時間や収入が一定の基準を下回る場合、社会保険の加入資格がない可能性があります。

社会保険に加入できない場合、配偶者は個人事業主であるあなたの国民健康保険に加入することになります。国民健康保険は、自営業者、フリーランス、無職の人などが加入する保険で、市区町村によって運営されています。国民健康保険に加入する場合、保険料は所得や世帯構成などに基づいて計算されます。

また、配偶者がパートタイムで働いている会社が社会保険に加入していない場合や、配偶者が社会保険の加入資格を持っていない場合でも、配偶者が一定の条件を満たしていれば、任意継続被保険者として健康保険に加入することも可能です。任意継続被保険者とは、退職後も一定期間、元の健康保険に継続して加入できる制度です。

したがって、個人事業主の配偶者がパートタイムで働いている場合、保険証が国民健康保険になるかどうかは、配偶者の労働条件や会社の社会保険加入状況、そして配偶者自身の選択によって決まります。詳細については、最寄りの社会保険事務所や市区町村の国民健康保険担当窓口に問い合わせることをお勧めします。