会社が従業員から不正に取得された交通費を回収することは可能です。日本の労働法に基づき、会社は従業員に対して不正行為に対する返還請求を行うことができます。具体的には、会社は従業員に対して返還を求める書面を送付し、返還期限を設定することが一般的です。従業員がこの期限内に返還しない場合、会社は法的手段を取ることができます。

また、会社は従業員の不正行為に対して懲戒処分を行うことも可能です。懲戒処分の種類には、減給、出勤停止、降格、そして最終的には解雇があります。従業員が不正行為を行った事実が明らかであり、その金額が大きい場合、解雇が考えられます。ただし、解雇には慎重な判断が必要であり、従業員の権利を侵害しないように配慮する必要があります。

さらに、会社は従業員の不正行為を防止するための措置を講じることも重要です。例えば、交通費の申請手続きを見直し、監査を強化することが考えられます。また、従業員に対して倫理教育を行い、不正行為のリスクを低減することも有効です。

以上のように、会社は従業員から不正に取得された交通費を回収することが可能であり、また懲戒処分を行うこともできます。ただし、これらの措置を講じる際には、法的な手続きを正しく行い、従業員の権利を侵害しないように注意する必要があります。