有給休暇の理由を説明する義務があるかどうかは、会社の就業規則や労働基準法によって異なります。労働基準法では、有給休暇は労働者の権利とされており、原則として理由を問わず取得できることになっています。しかし、実際の運用では、会社によっては有給休暇の取得に際して理由を求める場合があります。これは、業務運営上の必要性や、有給休暇の濫用を防ぐための措置として行われることがあります。

あなたの場合、上司から有給休暇の理由を詳細に説明するよう求められ、さらには欠勤扱いにされるという過剰な対応を受けています。このような状況では、まずは会社の就業規則を確認し、有給休暇に関する規定がどのようになっているかを把握することが重要です。就業規則に明確な規定がない場合や、規定に違反する対応を受けた場合には、労働基準監督署に相談することができます。労働基準監督署は、労働者の権利を守るための行政機関であり、労働条件や労働環境に関する問題について相談を受け付けています。

また、会社内に信頼できる相談窓口がない場合には、労働組合に加入することも一つの選択肢です。労働組合は、労働者の権利擁護や労働条件の改善を目的として活動しており、個々の労働者の問題についても相談を受け付けています。労働組合を通じて、会社との交渉や問題解決を図ることができます。

最後に、上司の偏った対応については、会社の人事部門や上層部に相談することも考えられます。ただし、その際には、冷静に事実を述べ、具体的な改善策を提案することが重要です。また、相談の際には、証拠となるメールやメモなどを準備しておくと、より効果的な対応が期待できます。

以上のように、有給休暇に関する問題は、労働基準法や会社の就業規則に基づいて適切に対処することが重要です。また、問題解決のためには、労働基準監督署や労働組合などの外部機関への相談も有効な手段となります。