日本の労働基準法により、労働者は一定の条件を満たすと有給休暇を取得する権利があります。具体的には、6ヶ月間継続勤務し、所定労働日の8割以上出勤した労働者に対し、10日以上の有給休暇が付与されます。その後、勤続年数が増すごとに、有給休暇の日数が増加します。

あなたの場合、2年間勤務しているため、相当数の有給休暇が付与されているはずです。上司が「規定以上の休みを取ったからだ」と言ったのは、おそらくあなたが事故で怪我をした際に、通常の有給休暇を超えて休んだことを指していると思われます。しかし、その際に有給休暇を使ったと明示的に言われていない限り、その休みが有給休暇として扱われたかどうかは不明です。

法的には、労働者が有給休暇を取得する権利は保障されており、使用する有給休暇の日数について、会社が勝手に決定することは許されません。もし、会社が正当な理由なく有給休暇の取得を拒否した場合、労働基準監督署に相談することができます。また、労働組合に加入している場合は、組合を通じて交渉することも可能です。

あなたの状況について、具体的な法的アドバイスを得るためには、労働問題に詳しい弁護士や労働基準監督署に相談することをお勧めします。彼らは、あなたの権利を守り、適切な解決策を見つけるための専門的なサポートを提供してくれるでしょう。