あなたの父親の状況は、労働条件の面でいくつかの問題点があるように見受けられます。まず、会社がガソリン代などの経費を支払わないことは、労働者の負担を不当に増やす可能性があります。これは労働基準法に違反する可能性があり、労働基準監督署に相談することで解決策を探ることができます。

次に、自営業扱いで確定申告を自分で行うことも問題です。通常、従業員は会社が年末調整を行い、確定申告は必要ありません。この状況は、会社が労働者を不当に自営業者として扱い、社会保険料や税金の負担を軽減している可能性があります。これも労働基準法に違反する行為であり、労働基準監督署や税務署に相談することが必要です。

また、収入がフリーター並みであることも問題です。労働者は、労働時間や能力に見合った適正な報酬を受け取る権利があります。収入が低すぎる場合、これも労働基準法に違反する可能性があります。

これらの問題に対処するためには、まずは労働基準監督署に相談し、状況を説明することが重要です。労働基準監督署は、労働者の権利を守るための機関であり、このような問題に対処するための専門的な知識と経験を持っています。また、税務署にも相談し、確定申告の扱いについて確認することも必要です。

最後に、あなた自身が学生であり、社会経験がないことを考慮すると、このような問題に対処するのは難しいかもしれません。しかし、労働者の権利は誰にでも平等に与えられており、あなたの父親の状況を改善するためには、適切な機関に相談し、適切なアドバイスを受けることが重要です。