日本の労働基準法により、有給休暇は労働者の権利として保障されています。ただし、その使用に関しては、会社の就業規則に従う必要があります。あなたの場合、有給休暇を使用するためには、取得日の3週間前までに申請し、会社の許可を得る必要があるという就業規則があります。あなたはこの規定に従わずに有給休暇を取得しようとしているため、会社から拒否されたという状況です。

会社が有給休暇の使用を拒否する理由は、業務の円滑な運営を確保するためです。あなたが事前に業務上問題なしと了承を得ていたとしても、就業規則に違反しているため、会社はその規則に基づいて対応する権利を持ちます。ただし、労働基準法第136条により、有給休暇を取得したことを理由に不利益な取り扱いを行うことは違法です。つまり、あなたが有給休暇を取得した後に、解雇や減給などの不利益な処分を受けることは違法です。

あなたが有給休暇を取得しようとする場合、会社との対立は避けられないかもしれません。あなたが近々退職する予定であることを考慮すると、会社との関係がさらに悪化する可能性があります。そのため、労働基準監督署に相談することをお勧めします。彼らは、労働基準法に基づいた適切なアドバイスを提供し、あなたの権利を守るための支援を行ってくれます。

また、会社の就業規則が労働基準法に違反している場合、労働基準監督署はその規則の是正を求めることができます。あなたの場合、会社の就業規則が労働基準法に違反しているかどうかを確認するために、労働基準監督署に相談することは有益です。彼らは、あなたの状況を詳しく聞いた上で、適切なアドバイスを提供してくれるでしょう。