妊娠中で新型コロナウイルスが怖くて会社に行きたくない場合、まずは医師に相談することが重要です。医師はあなたの健康状態と赤ちゃんの安全を考慮して、適切なアドバイスを提供してくれます。また、会社の人事部門に相談し、妊娠中の特別な事情を説明することも大切です。労働基準法により、妊娠中の女性労働者は健康上の理由で休業を請求する権利があります。会社はこの請求を拒否することはできません。ただし、休業期間中の給与については、会社の規定や労働契約により異なる場合があります。また、勤務地の環境や通勤ルートのリスクを最小限にするための対策も考える必要があります。例えば、オフィスの換気を良くする、マスク着用の徹底、通勤時間帯の変更などが考えられます。最終的な決定は、医師のアドバイス、会社との協議、そして家族との話し合いを経て行うことが望ましいです。