最低賃金法に基づき、深夜勤務の割増賃金は最低賃金に基づいて計算されます。具体的には、最低賃金に深夜勤務の割増率（通常は25%）を加算した額が、深夜勤務の最低賃金となります。あなたの場合、2年前に時給が1200円から1250円に引き上げられたことから、その後の最低賃金の引き上げにより、他の従業員と同様に時給が調整される可能性があります。しかし、派遣契約によっては、既に高い時給が設定されている場合、最低賃金の引き上げによる調整が行われないこともあります。これは、派遣会社との契約内容や、その時点での市場の需給状況によって異なります。具体的な調整については、派遣会社に直接確認することをお勧めします。また、労働基準監督署に相談することも、法的な観点からの確認に役立つでしょう。