会社を退職する際にパワハラを受け、労働基準局のアドバイスに従って書留で退職届を送った後、会社から事実確認のための電話連絡を求められた場合、メールで返信することは適切です。以下に、その理由と具体的な対応方法を詳しく説明します。

メールで返信する理由

1. 心理的負担の軽減: パワハラを受けた経験がある場合、部長と直接話すことは心理的に大きな負担となる可能性があります。メールで返信することで、直接的な対面や電話でのやり取りを避け、心理的な負担を軽減することができます。
2. 記録の残存: メールで返信することで、コミュニケーションの記録が残ります。これは、後日何か問題が生じた場合に、自分の主張を証明するための証拠として利用できます。
3. 冷静な対応: メールで返信することで、冷静に内容を考え、整理して伝えることができます。電話での即時対応よりも、より慎重で適切な返答を行うことが可能です。

メール返信の具体的な方法

1. 件名: 件名は明確にし、「退職に関する事実確認のご連絡」など、内容が一目でわかるものにします。
2. 本文: 本文では、まず自己紹介と返信の目的を簡潔に述べます。その後、退職の旨を再度明確に伝え、労働基準局のアドバイスに従って書留で退職届を送ったことを説明します。最後に、電話での対応が困難な理由（例：心理的負担、時間的制約など）を述べ、メールでの返信を希望する旨を伝えます。
3. 終わり方: 最後に、「何かご不明な点がございましたら、メールにてご連絡ください」など、継続的なコミュニケーションを促す文言を添えます。

注意点

• 法的な観点: 労働基準法に基づき、退職届は書面で提出することが求められています。書留で送付したことで、法的にも有効な退職届となっているはずです。
• 会社の規則: 会社の内部規則によっては、特定の方法での退職手続きが求められる場合があります。この点については、会社の人事部門に確認することも一考です。

以上のように、メールで返信することは適切であり、心理的負担の軽減や記録の残存といったメリットがあります。ただし、会社の規則や法的な要件にも留意し、必要に応じて専門家の助言を求めることも重要です。