日本の労働基準法によれば、労働者は退職する場合、最低でも2週間前までに会社に通知すれば法的には問題ありません。しかし、多くの会社では独自の就業規則や就業契約書に、退職の際には2ヶ月前までに申し出ることを定めています。これは、会社が業務の引継ぎや後任者の確保に十分な時間を確保するためです。

あなたの場合、入社時にそのような書類に署名しているため、会社の規定に従うことが法的にも道義的にも求められます。ただし、会社の環境が極めて悪く、精神的なストレスが深刻である場合、労働基準監督署に相談することで、状況に応じた対応を取ることができる可能性があります。

また、退職願を提出した後の欠勤については、会社が欠勤扱いとするか、無給休暇とするかは会社の判断になります。ただし、欠勤扱いとなった場合、給与の減額や退職金の減額などのリスクがありますので、慎重に判断する必要があります。

最終的には、会社との話し合いを通じて、可能な限り早い退職日の調整を図ることが望ましいです。その際、自身の法的権利を理解し、適切なアドバイスを受けながら進めることが重要です。