有給休暇を取得した場合に欠勤扱いにされ、皆勤手当が支給されなくなることは、法律的には適切ではありません。日本の労働基準法により、有給休暇は労働者の権利として認められており、使用することができます。有給休暇を取得した日は、労働基準法第39条に基づき、出勤したものとみなされます。したがって、有給休暇を取得した日を欠勤として扱うことは、労働基準法に違反します。

また、皆勤手当についても、有給休暇を取得した日を欠勤として扱い、それによって皆勤手当を支給しないことは、労働者の権利を不当に侵害するものです。皆勤手当は、労働者が一定期間出勤したことに対する報酬であり、有給休暇を取得した日も出勤したものとみなされるため、その日を欠勤として扱うことは適切ではありません。

このような問題については、労働基準監督署に相談することができます。労働基準監督署は、労働基準法の違反について調査し、是正措置を講じる権限を持っています。また、労働組合に加入し、団体交渉を行うことも一つの解決策となります。

労働者の権利を守るためには、労働基準法を正しく理解し、適切な手段を講じることが重要です。