妻の職場がブラック企業かどうかを判断するためには、いくつかの要素を考慮する必要があります。ブラック企業とは、労働基準法に違反したり、従業員の権利を侵害したりする企業を指します。以下に、あなたが挙げた妻の職場の状況について、それぞれの問題点とその解決策を詳しく説明します。

1. 時短勤務申請しているが、1度も時短の定時退社時間に帰れた事が無い(通常定時にも帰れない)
   これは、労働時間の規定に違反している可能性があります。労働基準法では、法定労働時間を超えて働かせる場合、36協定を結ぶ必要があります。また、時短勤務の申請が受理されているにもかかわらず、それが守られていない場合は、労働基準監督署に相談することができます。

2. お昼休憩を15分しか取れない(弁当食べるだけ)
   労働基準法では、6時間以上の労働に対して少なくとも45分の休憩を与えることが義務付けられています。15分の休憩は明らかにこの規定に違反しています。

3. 休みの日に、会社で使う備品を購入(勤務時間内に行けない)
   これは、従業員のプライベートタイムを侵している可能性があります。会社の業務に関する購入は、通常勤務時間内に行うべきです。

4. 上司に相談があっても、私はその話は聞かないと言われる(都合の悪い話は聞かない)
   これは、従業員の意見や問題を無視する態度であり、職場環境の悪化につながります。

5. 休みの日に電話がかかってくる
   休日に業務上の連絡があること自体は問題ありませんが、頻繁に発生する場合は、従業員のプライベートタイムを侵している可能性があります。

6. 台風時に出勤等の指示が無く、仕方なく出社、上司は来ないし連絡もない
   これは、安全面での問題があります。台風などの災害時には、従業員の安全を最優先に考えるべきです。

7. 給料が低い月があり、数ヶ月後に差額が振り込まれる(連絡無し)
   給与の支払いは、労働基準法に基づいて正確かつ適時に行われるべきです。給与の遅延や不明瞭な支払いは違法です。

8. 会社で使うボールペンなど、全て自腹で購入
   業務に必要な物品は、通常会社が提供するべきです。従業員が自費で購入することは、会社の責任を軽視していると言えます。

これらの状況は、妻の職場がブラック企業の特徴を多く持っていることを示唆しています。しかし、最終的な判断は労働基準監督署などの専門機関に委ねるべきです。妻がこれらの問題に直面している場合、労働組合に加入するか、労働基準監督署に相談することを検討することが重要です。また、会社の人事部門や上司に直接相談することも一つの方法ですが、その場合は、相談の内容を記録し、証拠を残すことが重要です。