上司から車を借りるように頼まれた場合、特にその車が新車であり、かつ自動車トランスミッション（MT）である場合、断ることは非常に難しい状況です。しかし、車の状態や安全性を考慮すると、断ることが最善の選択となることもあります。以下に、上司に車を貸さないように断るためのいくつかの方法を提案します。

1. 事実に基づいた理由を提供する：上司に対して、車が新しく、まだ十分に慣れていないため、他人に貸すのが不安であると説明します。特にMTの場合、運転技術が必要であり、その技術が不足していると感じる場合は、その点を強調することができます。

2. 代替案を提案する：上司に対して、車を貸さない代わりに、レンタカーを利用することを提案します。レンタカーはETCカード付きの車も多く、上司のニーズに合うかもしれません。また、レンタカーの場合、車の状態について心配する必要がなく、安心して利用できます。

3. 感謝と敬意を示す：上司に対して、日頃のお世話に感謝の意を表し、車を貸すことができないことを残念に思うと伝えます。その上で、車を貸すことができない理由を説明し、上司が理解してくれるように努めます。

4. 断り方を練習する：断り方を練習し、上司に対して自信を持って断ることが重要です。断り方を練習することで、上司に対して誠実でありながらも、自分の立場をしっかりと守ることができます。

5. 上司との信頼関係を維持する：上司との信頼関係を維持するために、車を貸すことができない理由を誠実に説明し、上司が理解してくれるように努めます。また、上司に対して、今後もお世話になることを期待し、信頼関係を維持することが重要です。

以上の方法を用いて、上司に車を貸さないように断ることができます。ただし、上司との関係を考慮し、状況に応じて適切な方法を選択することが重要です。