会計年度任用職員は1年任用で2回更新されますが、4月1日から3月31日までの期間で、既に働いている会計年度任用職員は総入替えされるのでしょうか？

会計年度任用職員の任期は通常、4月1日から翌年の3月31日までの1年間です。この期間中に2回更新されることがありますが、その場合でも基本的には同じ職員が継続して勤務することが一般的です。ただし、職員の評価や組織のニーズによっては、一部の職員が入れ替わることもあります。総入替えという形で全員が入れ替わることは稀ですが、組織の再編や大幅な方針転換がある場合には可能性があります。具体的な状況は各組織の人事方針や現在の状況によりますので、直接所属する組織に確認することをお勧めします。