派遣先で残業がカウントされない問題は、労働者の権利を侵害する重大な問題です。まず、残業の申請がシステム上で通常勤務としてカウントされることは、労働基準法に違反している可能性があります。労働基準法では、労働時間の管理と残業代の支払いについて明確な規定があり、企業はこれに従う義務があります。

具体的な対応策として、まずは派遣会社に対して、この問題の解決を求めることが重要です。派遣会社は派遣労働者の労働条件を管理する責任があり、派遣先企業との交渉を通じて問題解決にあたるべきです。派遣会社が対応しない場合、労働基準監督署に相談することが考えられます。労働基準監督署は、労働基準法違反の是正を行う公的機関であり、労働者の権利を守るための調査や指導を行います。

また、残業の記録を詳細に取ることも重要です。日付、時間、作業内容、申請の有無、承認の状況などを記録しておくことで、労働基準監督署への相談時に証拠として提出することができます。

このような問題は、労働者の権利意識の向上とともに、企業の社会的責任の観点からも問題視されるべきです。派遣先企業が名の通った企業であるからこそ、社会的な信頼を維持するためにも、法的に正しい対応を取ることが求められます。

最後に、この問題が解決しない場合、弁護士に相談して法的措置を取ることも一つの選択肢です。法的手段を通じて、労働者の権利を守ることが可能です。

以上のように、残業がカウントされない問題は、労働者の権利を守るために、適切な対応策を講じることが重要です。