会社都合による転勤で片道2時間30分～3時間の通勤を強要され、会社の規定に基づき宿泊申請が却下された場合、以下の手順で対処することが考えられます。

まず、労働基準法により、使用者は労働者に過度の通勤を強制することはできません。具体的には、労働基準法第109条により、使用者は労働者に対して過重な労働を強制することが禁止されています。通勤時間も労働時間の一部とみなされるため、過度の通勤は過重労働に該当する可能性があります。

次に、会社の規定について、それが労働基準法に違反していないかを確認する必要があります。会社の規定が労働基準法に違反している場合、その規定は無効となります。

さらに、労働基準監督署に相談することも一つの手段です。労働基準監督署は、労働基準法の適用を監督し、労働者の権利を保護する機関です。労働基準監督署に相談することで、会社の規定が適法かどうか、また、あなたの権利が侵害されていないかを確認することができます。

また、労働組合に加入し、労働組合を通じて会社と交渉することも考えられます。労働組合は労働者の権利を擁護し、労働条件の改善を図るための組織です。労働組合を通じて、会社との交渉を行うことで、通勤時間の短縮や宿泊施設の提供などの改善を求めることができます。

最後に、裁判所に訴えることも一つの手段です。会社との交渉がうまくいかない場合、裁判所に訴えることで、あなたの権利を擁護することができます。ただし、裁判所に訴える場合、法的な知識が必要となるため、弁護士に相談することをお勧めします。

以上の手順を踏むことで、会社都合による過度の通勤強要に対して、適切に対処することができます。