有休休暇の付与方法は、労働基準法に基づいて会社の就業規則に定められています。一般的に、パートから正社員に転換した場合、その転換時点での有休休暇の残日数はそのまま引き継がれます。つまり、あなたの会社の場合、パート時代に付与された3日の有休休暇は正社員としても継続して利用可能です。

次に、正社員としての有休休暇の付与についてですが、通常、正社員としての勤務開始日から新たに有休休暇の付与がスタートします。あなたの会社の就業規則によると、3か月経過後に有休休暇が付与されるとのことですので、正社員としての勤務開始日である4月1日から3か月後の7月1日に、新たに10日の有休休暇が付与されることになります。

したがって、パートから正社員に転換した方の有休休暇の残日数は、パート時代の残日数3日に、正社員として付与される10日を加えた、合計13日となります。この計算方法は、労働基準法に基づく一般的な取り扱いであり、あなたの会社の就業規則に特別な定めがない限り、この方法で有休休暇を付与することが適切です。

なお、有休休暇の付与日数や付与タイミングは、各会社の就業規則によって異なる場合がありますので、具体的な取り扱いについては、必ず就業規則を確認することをお勧めします。また、労働基準監督署に相談することも、法的な観点から確認する一つの手段です。