日本の労働基準法により、生理休暇は女性労働者の権利として認められており、これを理由に賞与の減額や不支給を行うことは違法です。具体的には、労働基準法第7条において、女性労働者に対する生理休暇の取得が保障されており、これを理由に不利益な取り扱いをすることは禁止されています。

あなたの場合、生理休暇を頻繁に取得しているとのことですが、これは法律によって保障された権利であり、会社がこれを理由に賞与の支給を拒否することは違法です。賞与の支給に関しては、会社の就業規則や賞与規定に基づいて判断されますが、生理休暇の取得が賞与に影響を与えることはありません。

ただし、賞与の支給基準が業績や勤務態度、出勤率などに基づいている場合、生理休暇以外の要因で評価が下がる可能性はあります。しかし、生理休暇自体が賞与の支給基準に影響を与えることはないと考えられます。

もし会社側が生理休暇の取得を理由に賞与の支給を拒否するような対応を示した場合、それは労働基準法に違反する可能性があります。そのような場合には、労働基準監督署に相談することをお勧めします。

また、会社が生理休暇に対して理解があるとのことですので、あなたの状況を上司や人事部に相談し、賞与の支給に関する明確な回答を得ることも一つの方法です。透明性のあるコミュニケーションを通じて、誤解や不安を解消することが重要です。