日本の多くの企業では、社員が配偶者と別居している場合に単身赴任手当を支給することが一般的です。しかし、その支給条件は各社の就業規則によって異なります。あなたのケースでは、妻が結婚前に転勤しており、結婚後も別居を続けているため、会社側はこれを単身赴任とは見なさないと判断した可能性があります。

会社の規定には結婚前後の転勤に関する具体的な記載がないため、この判断は会社の裁量によるものと考えられます。しかし、同社内で結婚している男性社員が転勤した場合には単身赴任扱いとなり手当が支給されるという事実があるため、この差別的な扱いに納得できない気持ちは理解できます。

このような場合、まずは会社の人事担当者に再度相談し、具体的な規定や判断基準を明確にすることが重要です。また、帰省旅費の支給についても、会社の規定を確認し、支給の可能性を探る価値があります。

さらに、労働基準監督署に相談することも一つの手段です。労働基準監督署は、労働者の権利を守るための機関であり、会社の規定や実際の扱いが労働基準法に違反していないかを確認することができます。

最終的には、会社との話し合いや法的な相談を通じて、最適な解決策を模索することが求められます。どのような選択をするにせよ、冷静で合理的な判断を下すことが重要です。