日本の職場において、会社が転勤に伴う住居の初期費用を負担するかどうかは、会社の転勤政策や労働契約によります。一般的に、会社は業務上の必要性に基づく転勤に対しては、住居の初期費用（敷金、礼金など）を負担することが多いです。しかし、自己都合による転勤の場合、会社がこれらの費用を負担する義務はありません。

自己都合の転勤では、会社が費用を負担しないことは一般的です。これは、転勤が個人的な選択であり、会社の業務上の必要性に基づかないためです。ただし、この点については、労働契約や就業規則、あるいは転勤に関する会社の方針を確認することが重要です。

また、転勤に関する費用負担については、労働者と会社の間で事前に合意が必要です。転勤前に、具体的な費用負担の範囲や条件について、明確な合意を取り交わすことが望ましいです。これにより、後々のトラブルを避けることができます。

結論として、自己都合による転勤で会社が住居の初期費用を負担しないことは一般的ですが、具体的な条件は各会社の方針によります。転勤に関する費用負担については、事前に会社としっかりと話し合い、合意を取り交わすことが重要です。