派遣社員としての契約期間中に派遣先を辞めた場合、派遣元が退職扱いにすることは一般的にはありません。派遣契約は派遣元と派遣先の間で結ばれるものであり、派遣社員が派遣先を辞めたからといって、派遣元との契約が自動的に終了するわけではありません。

しかし、派遣契約によっては、派遣先での勤務がなくなった場合に派遣元との契約も終了するという条項が含まれていることがあります。このような場合、派遣元が退職扱いにすることは法的に問題ありません。

また、派遣社員が派遣先を辞めた理由が、例えば契約違反や職務怠慢などの問題行為であった場合、派遣元が契約を終了することもあります。この場合、派遣元は退職扱いにする前に、派遣社員に対して適切な通知や手続きを行う必要があります。

あなたの場合、派遣元に退職届を出していないにもかかわらず退職扱いにされたとのことですが、これは派遣契約の内容や派遣元の内部規定によるものと考えられます。もし、派遣元の行為に納得がいかない場合は、労働基準監督署に相談することをお勧めします。労働基準監督署は、労働者の権利を守るための機関であり、あなたの状況を詳しく聞いて適切なアドバイスを提供してくれるでしょう。