NC旋盤でアラームが頻発する問題について、まずは機械の状態を包括的に確認する必要があります。アラーム3（非常停止）、25（安全監視アラーム）、41（主軸異常1）が同時に発生することから、これらのアラームが示す問題は互いに関連している可能性が高いです。具体的な原因を特定するためには、以下の点を確認してください。

1. 電気系統の確認：電源ケーブルやコネクターの接続不良、電圧の不安定、電気部品の故障などが考えられます。
2. 機械の動作状態：主軸の回転状態、工具の取り付け状態、加工物の固定状態などを確認します。
3. ソフトウェアの設定：NCプログラムの設定ミス、パラメータの設定ミスなどが考えられます。
4. 環境条件：温度や湿度などの環境条件が機械の動作に影響を与えている可能性もあります。

また、リセットボタンでアラームが解除できなくなったことは、問題が深刻化していることを示唆しています。マザックのサポートによる基盤交換が効果を上げなかった場合、他のハードウェア部品やソフトウェアの問題を疑う必要があります。

最終的には、専門の技術者による詳細な診断が必要です。マザックのサポートに再度連絡し、機械の詳細な状態を報告し、さらなる調査を依頼することをお勧めします。