会社名義で借りている住宅に住んでいる場合、退職時に発生する敷金や違約金の問題は複雑です。まず、敷金は通常、借主が退去する際に原状回復費用や未払いの家賃などを差し引いた残額が返還されます。しかし、あなたの場合、敷金が全額返還されないということです。

この状況では、まず会社との契約内容を確認することが重要です。特に、退職時の敷金返還に関する規定があるかどうかを確認しましょう。もし、契約にそのような規定がない場合、会社が敷金を返還しないことは法的に問題がある可能性があります。

次に、転勤時の負担についても考慮する必要があります。会社都合で転勤となり、その際の負担が大きかったということですが、これが敷金返還に影響を与えるかどうかは、会社の方針や法的な規定によります。

支払わないようにするためには、まず会社との交渉が必要です。交渉の際には、転勤時の負担や退職の理由を明確に伝え、敷金返還の必要性を説明することが重要です。また、もし交渉がうまくいかない場合、労働基準監督署や弁護士に相談することも一つの手段です。

最終的には、会社との関係性や法的な規定を踏まえて、最善の解決策を模索することが求められます。