退職時の社会保険料や厚生年金料の支払いについては、基本的にはその月の給与から天引きされる形で徴収されます。しかし、あなたのケースでは、会社の都合で有給を9月に回したことにより、9月分の給与が発生しなかったため、社会保険料や厚生年金料の支払い通知が届いたという状況です。

この場合、基本的には会社が社会保険料や厚生年金料を負担する義務があります。なぜなら、これらの保険料は労働者と会社が折半して負担するものであり、労働者が実際に働いた分の給与が発生しなかった場合、会社が負担する部分が増えることになるからです。

したがって、会社に対して、社会保険料や厚生年金料の支払いを求めることは適切ではありません。会社がこれらの費用を負担することが一般的な取り扱いです。もし会社がこの点を理解せず、労働者に対して不当な請求を行っている場合は、労働基準監督署や弁護士に相談することをお勧めします。

また、退職後の社会保険や年金の手続きについても、会社が適切に行う必要があります。退職後は、国民年金に切り替える手続きや、健康保険組合から国民健康保険への切り替え手続きが必要となります。これらの手続きは、退職後14日以内に行う必要がありますので、会社に確認し、必要な手続きを行うようにしてください。

以上が、退職時の社会保険料や厚生年金料の支払いに関する一般的な解説です。具体的な状況に応じて、適切な対応を取ることが重要です。