日本の労働法において、転勤は労働契約の一部として扱われることが多いです。就業規則に「社員は転勤がある」と明記されている場合、これは労働契約の一部とみなされ、社員はこの規則に従う義務があります。したがって、女性社員が転勤を拒否することは難しいと言えます。ただし、転勤が過度に困難である場合や、家族の事情など個人的な事情がある場合には、会社との交渉の余地があるかもしれません。

また、会社が就業規則に明記されていない方針を自由に決定できるかについては、その方針が労働契約の内容を大きく変更するものである場合、労働者の同意が必要となります。ただし、就業規則に「社員は転勤がある」と明記されている場合、この規則を適用する範囲を拡大することは、一般的には許容されると考えられます。ただし、このような変更が労働者に不当な負担を強いるものである場合、労働基準監督署などの関係機関に相談することができます。

結論として、就業規則に転勤の規定がある場合、女性社員が転勤を拒否することは難しいですが、個人的な事情がある場合には交渉の余地があります。また、会社が就業規則に明記されていない方針を導入する場合、労働者の同意が必要となる場合があります。